MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 30148

< Previous12...49505152535455565758596061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_013926	ATT	2	6	1479212	1479217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597218
30002	NC_013926	TTAT	2	8	1479225	1479232	25 %	75 %	0 %	0 %	289597218
30003	NC_013926	CTC	2	6	1479281	1479286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
30004	NC_013926	T	6	6	1479323	1479328	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30005	NC_013926	ATATA	2	10	1479342	1479351	60 %	40 %	0 %	0 %	289597218
30006	NC_013926	TCA	2	6	1479381	1479386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597218
30007	NC_013926	TAT	2	6	1479470	1479475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597218
30008	NC_013926	ATT	2	6	1479489	1479494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597218
30009	NC_013926	GCT	3	9	1479648	1479656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289597218
30010	NC_013926	T	6	6	1479656	1479661	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30011	NC_013926	CAT	2	6	1479788	1479793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597218
30012	NC_013926	TTC	2	6	1479803	1479808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597218
30013	NC_013926	GCTC	2	8	1479834	1479841	0 %	25 %	25 %	50 %	289597218
30014	NC_013926	ATA	2	6	1479854	1479859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597218
30015	NC_013926	TTTC	2	8	1479888	1479895	0 %	75 %	0 %	25 %	289597218
30016	NC_013926	AATT	2	8	1479922	1479929	50 %	50 %	0 %	0 %	289597218
30017	NC_013926	TAT	2	6	1479956	1479961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597218
30018	NC_013926	TAAA	2	8	1479978	1479985	75 %	25 %	0 %	0 %	289597218
30019	NC_013926	T	6	6	1479992	1479997	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30020	NC_013926	TCC	2	6	1480029	1480034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
30021	NC_013926	TAA	2	6	1480111	1480116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597218
30022	NC_013926	CT	4	8	1480161	1480168	0 %	50 %	0 %	50 %	289597218
30023	NC_013926	AGA	2	6	1480383	1480388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597218
30024	NC_013926	CAA	2	6	1480399	1480404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597218
30025	NC_013926	ATTATC	2	12	1480428	1480439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597218
30026	NC_013926	ATA	2	6	1480466	1480471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597218
30027	NC_013926	TA	3	6	1480470	1480475	50 %	50 %	0 %	0 %	289597218
30028	NC_013926	CTAT	2	8	1480491	1480498	25 %	50 %	0 %	25 %	289597218
30029	NC_013926	CAT	2	6	1480570	1480575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597218
30030	NC_013926	CTA	2	6	1480594	1480599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597218
30031	NC_013926	ATCC	2	8	1480601	1480608	25 %	25 %	0 %	50 %	289597218
30032	NC_013926	C	6	6	1480607	1480612	0 %	0 %	0 %	100 %	289597218
30033	NC_013926	AT	3	6	1480613	1480618	50 %	50 %	0 %	0 %	289597218
30034	NC_013926	ATCAA	2	10	1480638	1480647	60 %	20 %	0 %	20 %	289597218
30035	NC_013926	AGA	2	6	1480648	1480653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597218
30036	NC_013926	CCT	2	6	1480697	1480702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
30037	NC_013926	T	6	6	1480707	1480712	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30038	NC_013926	AT	3	6	1480741	1480746	50 %	50 %	0 %	0 %	289597218
30039	NC_013926	ATCC	2	8	1480802	1480809	25 %	25 %	0 %	50 %	289597218
30040	NC_013926	TCC	2	6	1480898	1480903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
30041	NC_013926	T	6	6	1480907	1480912	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30042	NC_013926	T	7	7	1480932	1480938	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30043	NC_013926	TCC	2	6	1480983	1480988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
30044	NC_013926	T	6	6	1481002	1481007	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30045	NC_013926	AG	3	6	1481042	1481047	50 %	0 %	50 %	0 %	289597218
30046	NC_013926	GAA	2	6	1481110	1481115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597218
30047	NC_013926	CTAT	2	8	1481127	1481134	25 %	50 %	0 %	25 %	289597218
30048	NC_013926	TCT	2	6	1481163	1481168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597218
30049	NC_013926	TC	3	6	1481183	1481188	0 %	50 %	0 %	50 %	289597218
30050	NC_013926	ACT	2	6	1481189	1481194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597218
30051	NC_013926	CT	3	6	1481253	1481258	0 %	50 %	0 %	50 %	289597218
30052	NC_013926	TA	3	6	1481353	1481358	50 %	50 %	0 %	0 %	289597218
30053	NC_013926	TCC	3	9	1481366	1481374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
30054	NC_013926	T	7	7	1481420	1481426	0 %	100 %	0 %	0 %	289597218
30055	NC_013926	AT	3	6	1481428	1481433	50 %	50 %	0 %	0 %	289597218
30056	NC_013926	TTA	2	6	1481568	1481573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597218
30057	NC_013926	CT	3	6	1481650	1481655	0 %	50 %	0 %	50 %	289597218
30058	NC_013926	TTCT	2	8	1481690	1481697	0 %	75 %	0 %	25 %	289597218
30059	NC_013926	ATGG	2	8	1481792	1481799	25 %	25 %	50 %	0 %	289597219
30060	NC_013926	AAAC	2	8	1481803	1481810	75 %	0 %	0 %	25 %	289597219
30061	NC_013926	AG	4	8	1481852	1481859	50 %	0 %	50 %	0 %	289597219
30062	NC_013926	CTT	2	6	1481976	1481981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597219
30063	NC_013926	GAT	2	6	1481999	1482004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597219
30064	NC_013926	GTT	2	6	1482008	1482013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289597219
30065	NC_013926	GA	3	6	1482022	1482027	50 %	0 %	50 %	0 %	289597219
30066	NC_013926	GAA	2	6	1482049	1482054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597219
30067	NC_013926	GA	3	6	1482064	1482069	50 %	0 %	50 %	0 %	289597219
30068	NC_013926	ATA	2	6	1482116	1482121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597219
30069	NC_013926	GAT	2	6	1482125	1482130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597219
30070	NC_013926	GGA	2	6	1482131	1482136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597219
30071	NC_013926	ACC	2	6	1482203	1482208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289597219
30072	NC_013926	GA	3	6	1482233	1482238	50 %	0 %	50 %	0 %	289597219
30073	NC_013926	GTG	2	6	1482377	1482382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289597219
30074	NC_013926	ATGG	2	8	1482491	1482498	25 %	25 %	50 %	0 %	289597219
30075	NC_013926	GAAT	2	8	1482604	1482611	50 %	25 %	25 %	0 %	289597219
30076	NC_013926	A	6	6	1482652	1482657	100 %	0 %	0 %	0 %	289597219
30077	NC_013926	AG	4	8	1482684	1482691	50 %	0 %	50 %	0 %	289597219
30078	NC_013926	GAA	2	6	1482707	1482712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597219
30079	NC_013926	CAA	2	6	1482724	1482729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597219
30080	NC_013926	A	6	6	1482728	1482733	100 %	0 %	0 %	0 %	289597219
30081	NC_013926	TAG	2	6	1482768	1482773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597219
30082	NC_013926	A	6	6	1482891	1482896	100 %	0 %	0 %	0 %	289597219
30083	NC_013926	AGA	2	6	1482979	1482984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597219
30084	NC_013926	AAG	2	6	1483131	1483136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597220
30085	NC_013926	AAG	2	6	1483318	1483323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597220
30086	NC_013926	AAG	2	6	1483370	1483375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597220
30087	NC_013926	AG	3	6	1483374	1483379	50 %	0 %	50 %	0 %	289597220
30088	NC_013926	T	6	6	1483424	1483429	0 %	100 %	0 %	0 %	289597220
30089	NC_013926	ATA	2	6	1483554	1483559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597220
30090	NC_013926	GAT	2	6	1483581	1483586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597220
30091	NC_013926	CTTT	2	8	1483634	1483641	0 %	75 %	0 %	25 %	289597220
30092	NC_013926	GTA	2	6	1483713	1483718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597220
30093	NC_013926	AGG	2	6	1483747	1483752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597220
30094	NC_013926	ACCC	2	8	1483777	1483784	25 %	0 %	0 %	75 %	289597220
30095	NC_013926	AGC	2	6	1483977	1483982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289597220
30096	NC_013926	CAA	2	6	1483985	1483990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597220
30097	NC_013926	CTT	2	6	1483996	1484001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597220
30098	NC_013926	AACC	2	8	1484044	1484051	50 %	0 %	0 %	50 %	289597220
30099	NC_013926	AACC	2	8	1484075	1484082	50 %	0 %	0 %	50 %	289597220
30100	NC_013926	TAT	2	6	1484124	1484129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597220
30101	NC_013926	ACA	2	6	1484149	1484154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597220
30102	NC_013926	GCC	2	6	1484173	1484178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289597220
30103	NC_013926	GA	4	8	1484290	1484297	50 %	0 %	50 %	0 %	289597221
30104	NC_013926	A	6	6	1484469	1484474	100 %	0 %	0 %	0 %	289597221
30105	NC_013926	AAT	2	6	1484592	1484597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597221
30106	NC_013926	TTC	2	6	1484632	1484637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597221
30107	NC_013926	GGA	2	6	1484713	1484718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597221
30108	NC_013926	GA	3	6	1484867	1484872	50 %	0 %	50 %	0 %	289597221
30109	NC_013926	A	6	6	1484875	1484880	100 %	0 %	0 %	0 %	289597221
30110	NC_013926	GAG	2	6	1484890	1484895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597221
30111	NC_013926	AT	3	6	1484936	1484941	50 %	50 %	0 %	0 %	289597221
30112	NC_013926	ACTCC	2	10	1485031	1485040	20 %	20 %	0 %	60 %	289597221
30113	NC_013926	GAAGA	2	10	1485174	1485183	60 %	0 %	40 %	0 %	289597221
30114	NC_013926	AGA	2	6	1485264	1485269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597221
30115	NC_013926	TGA	2	6	1485309	1485314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597221
30116	NC_013926	AAG	2	6	1485343	1485348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597221
30117	NC_013926	GA	3	6	1485373	1485378	50 %	0 %	50 %	0 %	289597221
30118	NC_013926	A	7	7	1485414	1485420	100 %	0 %	0 %	0 %	289597221
30119	NC_013926	GAA	2	6	1485486	1485491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597221
30120	NC_013926	AAT	2	6	1485492	1485497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597221
30121	NC_013926	TA	3	6	1485510	1485515	50 %	50 %	0 %	0 %	289597221
30122	NC_013926	TCT	2	6	1485516	1485521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597221
30123	NC_013926	GAG	2	6	1485579	1485584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597222
30124	NC_013926	TAC	2	6	1485651	1485656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597222
30125	NC_013926	TCT	2	6	1485689	1485694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597222
30126	NC_013926	TGA	2	6	1485785	1485790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222
30127	NC_013926	AT	3	6	1485811	1485816	50 %	50 %	0 %	0 %	289597222
30128	NC_013926	GAT	2	6	1485845	1485850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222
30129	NC_013926	CCA	2	6	1485905	1485910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289597222
30130	NC_013926	TGGG	2	8	1485940	1485947	0 %	25 %	75 %	0 %	289597222
30131	NC_013926	ATT	2	6	1485967	1485972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597222
30132	NC_013926	AAGAA	2	10	1486004	1486013	80 %	0 %	20 %	0 %	289597222
30133	NC_013926	AGAGA	2	10	1486035	1486044	60 %	0 %	40 %	0 %	289597222
30134	NC_013926	GAA	2	6	1486045	1486050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597222
30135	NC_013926	A	6	6	1486207	1486212	100 %	0 %	0 %	0 %	289597222
30136	NC_013926	TAA	2	6	1486261	1486266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
30137	NC_013926	GGA	2	6	1486286	1486291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597222
30138	NC_013926	CTT	2	6	1486320	1486325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597222
30139	NC_013926	AATC	2	8	1486336	1486343	50 %	25 %	0 %	25 %	289597222
30140	NC_013926	GGAA	2	8	1486385	1486392	50 %	0 %	50 %	0 %	289597222
30141	NC_013926	TAA	2	6	1486417	1486422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
30142	NC_013926	AAAATT	2	12	1486455	1486466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
30143	NC_013926	AGATG	2	10	1486544	1486553	40 %	20 %	40 %	0 %	289597222
30144	NC_013926	ATA	2	6	1486608	1486613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
30145	NC_013926	ATA	2	6	1486626	1486631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
30146	NC_013926	ATG	2	6	1486650	1486655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222
30147	NC_013926	GA	3	6	1486711	1486716	50 %	0 %	50 %	0 %	289597222
30148	NC_013926	ATG	2	6	1486729	1486734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222

< Previous12...49505152535455565758596061Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.